Как мне перейти с другого Lightbox плагина на ваш?

Надеюсь вы задумались об этом. Если да, то с каких плагинов это возможно? Сайтов много, и Lightbox плагинов установленных на них тоже много разных.

В настройке плагина, в пункте Селектор, вам необходимо указать селектор с вашим CSS классом вывода изображений на вашем сайте. Lightbox плагин, который вы хотите сменить на Ads.MediaBox нужно просто деактивировать.
 
Ничего более делать не надо. Ads.Mediabox начнет работать с указанным вами селектором, обрабатывая все изображения. Более подробная информация о настройке Селектора приведена тут и тут.